Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRTM2O43300 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRRTM2O43300 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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