Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRXO43186 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRXO43186 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRXO43186 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRXO43186 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRXO43186 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CRXO43186 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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