Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP290O15078 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP290O15078 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP290O15078 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP290O15078 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP290O15078 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP290O15078 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP290O15078 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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CEP290O15078 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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CEP290O15078 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP290O15078 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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CEP290O15078 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CEP290O15078 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP290O15078 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP290O15078 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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