Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EBAG9O00559 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms