Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAP23O00161 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP23O00161 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms