Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPIPB9F8W1W9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms