Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERVV-1B6SEH8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms