Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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LINC00587B1AMM8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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LINC00587B1AMM8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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LINC00587B1AMM8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
LINC00587B1AMM8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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