Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WASHC1A8K0Z3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms