Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC69A6NI79 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms