Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf170A2RU37 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms