Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PIPSLA2A3N6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIPSLA2A3N6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms