Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IGHV3-16A0A0C4DH30 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms