Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6M5

SLC30A1, Zinc transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A1Q9Y6M5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC30A1Q9Y6M5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC30A1Q9Y6M5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC30A1Q9Y6M5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC30A1Q9Y6M5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC30A1Q9Y6M5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A1Q9Y6M5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC30A1Q9Y6M5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC30A1Q9Y6M5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC30A1Q9Y6M5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms