Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX9Q9Y5X1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX9Q9Y5X1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX9Q9Y5X1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX9Q9Y5X1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms