Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3AQ9Y496 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF3AQ9Y496 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF3AQ9Y496 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KIF3AQ9Y496 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIF3AQ9Y496 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 849 ms