Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHTOPQ9Y3Y2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHTOPQ9Y3Y2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHTOPQ9Y3Y2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms