Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3BP1Q9Y3L3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms