Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D5

MRPS18C, 28S ribosomal protein S18c, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS18CQ9Y3D5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPS18CQ9Y3D5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS18CQ9Y3D5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPS18CQ9Y3D5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPS18CQ9Y3D5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms