Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A8Q9Y2E8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9A8Q9Y2E8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A8Q9Y2E8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms