Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3LQ9Y262 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3LQ9Y262 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3LQ9Y262 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3LQ9Y262 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3LQ9Y262 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3LQ9Y262 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3LQ9Y262 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3LQ9Y262 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms