Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SHANK2Q9UPX8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SHANK2Q9UPX8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SHANK2Q9UPX8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SHANK2Q9UPX8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SHANK2Q9UPX8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SHANK2Q9UPX8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms