Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRAK1Q9UPV9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRAK1Q9UPV9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRAK1Q9UPV9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRAK1Q9UPV9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
TRAK1Q9UPV9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.2 ms