Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC8A2Q9UPR5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC8A2Q9UPR5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC8A2Q9UPR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC8A2Q9UPR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC8A2Q9UPR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms