Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK3Q9UPE1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRPK3Q9UPE1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPK3Q9UPE1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPK3Q9UPE1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPK3Q9UPE1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms