Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMCC3Q9ULS5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMCC3Q9ULS5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCC3Q9ULS5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCC3Q9ULS5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms