Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXL4Q9UKA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXL4Q9UKA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXL4Q9UKA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms