Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3LQ9UJW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNMT3LQ9UJW3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNMT3LQ9UJW3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3LQ9UJW3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms