Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO40Q9UH90 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO40Q9UH90 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FBXO40Q9UH90 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FBXO40Q9UH90 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FBXO40Q9UH90 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms