Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNAL1Q9UBT7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNAL1Q9UBT7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNAL1Q9UBT7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNAL1Q9UBT7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms