Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DKK4Q9UBT3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DKK4Q9UBT3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms