Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRFN1Q9P244 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRFN1Q9P244 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRFN1Q9P244 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms