Protein–RNA interactions for Protein: Q9P032

NDUFAF4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF4Q9P032 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF4Q9P032 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFAF4Q9P032 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFAF4Q9P032 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAF4Q9P032 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms