Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ARHGEF12Q9NZN5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ARHGEF12Q9NZN5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF12Q9NZN5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.74
ARHGEF12Q9NZN5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms