Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM53CQ9NYF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM53CQ9NYF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM53CQ9NYF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM53CQ9NYF3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM53CQ9NYF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms