Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHBDL2Q9NX52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDL2Q9NX52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDL2Q9NX52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms