Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJC28Q9NX36 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJC28Q9NX36 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC28Q9NX36 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms