Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TBCCD1Q9NVR7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms