Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IMP3Q9NV31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IMP3Q9NV31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP3Q9NV31 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IMP3Q9NV31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IMP3Q9NV31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms