Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM8Q9NQV8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM8Q9NQV8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRDM8Q9NQV8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM8Q9NQV8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms