Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCUBE2Q9NQ36 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCUBE2Q9NQ36 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCUBE2Q9NQ36 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCUBE2Q9NQ36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCUBE2Q9NQ36 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms