Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASCL3Q9NQ33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ASCL3Q9NQ33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASCL3Q9NQ33 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms