Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD3Q9NPG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD3Q9NPG1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FZD3Q9NPG1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FZD3Q9NPG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 770.2 ms