Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NGRNQ9NPE2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NGRNQ9NPE2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms