Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PARVBQ9HBI1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARVBQ9HBI1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARVBQ9HBI1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVBQ9HBI1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVBQ9HBI1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms