Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK4Q9HAZ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK4Q9HAZ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLK4Q9HAZ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK4Q9HAZ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms