Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ELP3Q9H9T3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ELP3Q9H9T3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ELP3Q9H9T3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ELP3Q9H9T3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms