Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SCAF1Q9H7N4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SCAF1Q9H7N4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SCAF1Q9H7N4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SCAF1Q9H7N4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SCAF1Q9H7N4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms