Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf49Q9H741 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf49Q9H741 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf49Q9H741 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf49Q9H741 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms