Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6W3

RIOX1, Ribosomal oxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX1Q9H6W3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RIOX1Q9H6W3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOX1Q9H6W3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOX1Q9H6W3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOX1Q9H6W3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOX1Q9H6W3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOX1Q9H6W3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOX1Q9H6W3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms